源起
1821 年， 新加坡只有12 或13 位天主教徒。1825年6月30日，葡萄牙传教士Fr Francisco da Silva Pinto e Maia为照顾这些教友而来到新加坡，葡萄牙传教使命就此开始。他向驻扎在新加坡的英国政府要求土地，以建教堂之用。当时，他获得了位于维多利亚街和奎因街之间的12块土地——其中的6块地是政府赠予，而另6块地则由葡萄牙东方传教会所购。在Fr Maia 的努力耕耘下，直到1829年，本地的天主教徒人数已增至200人。
到了1840年，Fr Maia已建造了堂区府，并着手为建圣若瑟堂而募款。但遗憾的是Fr Maia自1847年病重后，就一蹶不起，并于1850年2月17日逝世，葬于福康宁的天主教墓地。
葡萄牙教堂
继任的葡萄牙籍道明会士Fr Vincente de Santa在1848年来到新加坡，并于1851年12月14日为建教堂而奠基。建堂的$15000费用，多数来自Fr Maia的募款所得，葡萄牙国王捐助$2000，其余的费用则由公共资助。教堂终于在1853年竣工，主要服务葡萄牙籍及欧亚籍的天主教徒。
1858年，Fr Vincente为教堂增建了走廊，即十字形教堂的左右翼部，$9000的费用多数来自葡萄牙政府，其余则由公共资助。
教堂名字的由来
Fr Maia为建教堂而募款时，就选择了圣若瑟为教堂的主保。原因有三：（一）Fr Maia在来新加坡之前，曾任教于澳门的圣若瑟修院；（二）他购买土地的部分资金来自中国葡萄牙东方传教会的基金，而这修会也属澳门圣若瑟书院；（三）资金的另一部分来自北京葡萄牙籍耶稣会士出售物业的受益，而其会院就称为圣若瑟会院。
当教堂建成后，就命名为圣若瑟堂，是为遵循Fr Maia的遗愿，也为纪念Fr Maia的贡献。
扩充教堂
1887年，澳门主教Dom Antonia Joaquim Medeiros下令扩充教堂，以应付与日俱增的教友人数。1891年3月21日，刚上任不久的新加坡葡萄牙传教会副总会长Fr Jose Joachim Baptist便召开会议，计划扩充教堂和募捐事宜。建堂费用预计$85,000，但募款了7年之久，因资金不足，计划一直未能有进展。1904年8月14日，新上任的澳门主教Dom Joao Paulino de Azevedo e Castro在圣若瑟堂召开会议，推动扩充教堂计划。他也在同年8月21日为新教堂奠基。
1906年，现有的教堂被拆毁后，便立即兴建新教堂。6年后，新教堂终于建成，并在1912年6月30日祝圣。
管理权之争
自17世纪就已有教会管理权之争。历史上，教宗曾授权允许葡萄牙国王拥有传教保教权，也就是说葡萄牙在海外开拓时，葡萄牙国王可在所属的地区，拥有保护传教的职责与权力，例如任命主教等权力。后来，西班牙也加入，就出现了为各自国家的利益，而禁止效忠其他国家的传教士到该地区传教。这严重地妨碍了教廷的权限和传教发展的原意。
1622年，教廷为主导传教工作而成立了传信部，然后又设立宗座代牧区，并派遣传教士到葡萄牙和西班牙保教权不及的地区从事传教工作。传信部所派遣的传教士就包括法国巴黎外方传教士、法国耶稣会士、意大利方济各会士、意大利遣使会士及教区神职人员。
19世纪的新加坡天主教会就处于葡萄牙传教保教权，以及教廷宗座代牧区的管理权之争中。1886年6月23日的政教协定，决定了新加坡的双重管理权，即圣若瑟堂受新加坡葡萄牙传教会的管理，隶属澳门主教；而其他教堂则属驻扎在新加坡的马六甲主教的管理。同一个地区却由两个主教管理，这局势持续了许多年，直到1970年代。
因政治局势的转变，教廷才与葡萄牙政府重谈此事。但圣若瑟堂与葡萄牙传教会已服务了7、8千名教友长达150年之久，葡萄牙的传统文化和宗教习俗也已根深蒂固。因此，谁也不愿意失去圣若瑟堂的独特性。教廷因此在初步的统一计划中，就向澳门主教提出保留这群体的特色。在圣若瑟堂教友的提议和几位领导人的商议下，协议书终于在1977年7月6日拟定。但因两位教宗的逝世以及葡萄牙的不安定局势，协议书一直拖延至1981年7月1日才得以生效，结束了95年的澳门管理及长达154年的双重管理权。
圣若瑟堂也因此不再是葡萄牙堂区，而是供教友敬拜的圣堂。旗下的7、8千名教友也属新加坡天主教总教区管理。协议的条件就包括澳门主教继续派遣葡萄牙传教士到圣若瑟堂服务。
1981年7月5日，杨瑞元总主教在圣若瑟堂主祭了感恩圣祭，并从澳门主教Arquiminio Rodriguesda Coasta 蒙席手中接过牧杖，表示接受圣若瑟堂的管理权。杨总主教也向教友承诺，将在天主的带领下，继续牧养新加坡的所有羊群。
今日的圣若瑟堂
1999年12月31日，澳门主教终止了派遣葡萄牙传教士到圣若瑟堂服务。因此，杨总主教也在2000年1月1日，重新调派神父来负责管理教堂，意即在圣若瑟堂服务的神父不再只是葡萄牙籍的神父。尽管如此，在圣若瑟堂举行的许多敬礼，例如每个月13日的法蒂玛圣母游行却从不间断，一直延续至今日。
圣若瑟堂是在2005年1月14日被列入国家古迹。教堂的72片彩色玻璃所覆盖的面积超过4千平方英尺。这新加坡最大的彩色玻璃收藏，从1912年至今，已有一个世纪的历史了。这些彩色玻璃多数来自比利时，而领洗池的彩色玻璃则来自意大利米兰。
多年的磨损，有些部分已损坏，而有些则已出现裂痕。这些彩色玻璃被层层的灰尘和污垢所覆盖着，早已暗淡无光。因此，在2012年7月20日开始修复工作。这耗资百万元的修复计划，终于在2014年11月完成。已有162年历史的圣若瑟堂，屹立不倒，更因彩色玻璃的修复，而恢复了昔日的光彩。
作者：Clement Liew／整理：白美珠
